Malattie legate al gene CASK

Guida per i genitori alla lettura di un referto genetico

All'inizio, i referti genetici possono sembrare di difficile comprensione. Spesso sono redatti per medici e scienziati, quindi contengono molte abbreviazioni, numeri e terminologia tecnica. Questa guida spiega alcuni dei termini più comuni in un linguaggio semplice.

Le nozioni di base

Un referto genetico serve a individuare eventuali alterazioni (chiamate varianti o mutazioni) nel DNA di una persona.

Il DNA è composto da quattro "lettere" chimiche:

A = Adenina
T = Timina
C = Citosina
G = Guanina

Queste lettere sono disposte in un ordine specifico, un po' come le lettere in una frase. I geni sono segmenti di DNA che contengono le istruzioni per la sintesi delle proteine. Le proteine aiutano il corpo e il cervello a crescere e a funzionare correttamente. Se le lettere del DNA cambiano, la proteina potrebbe non funzionare correttamente.

Comprendere il nome del gene

Esempio: gene CASK

Questo ti permette di sapere quale gene è stato colpito. Ogni gene ha un nome unico, un po' come il titolo di un libro.

Cosa significa "variante"?

Esempio: Variante patogena nel gene CASK

Per "variante" si intende una modifica nella sequenza del DNA. Esistono diversi termini che descrivono l'entità di tale modifica:

Benign = harmless
Likely benign = probably harmless
Variant of uncertain significance (VUS) = not enough is known about this change to determine if it would cause disease
Likely pathogenic = probably disease-causing
Pathogenic = known to cause disease

Comprendere i numeri e le lettere

Potresti vedere qualcosa del tipo: c.2451del

Sembra spaventoso, ma è solo un codice che spiega la mutazione del DNA rilevata:

c. = sequenza di DNA codificante
2451 = la posizione nel gene in cui si è verificata la mutazione
del = delezione (manca un frammento di DNA)

Allora c.2451del significa: «Una base del DNA è stata eliminata nella posizione 2451 del gene».

Esempio di variante missenso

Esempio: c.214G>A — è cambiata una sola base del DNA.

214 = posizione nel gene
G>A = la lettera G del DNA è diventata A

Esempio di duplicazione

Esempio: c.1200_1203dup

1200_1203 = la porzione di DNA interessata
duplicato = duplicazione

"Una piccola porzione di DNA è stata copiata per errore due volte."

Abbreviazioni comuni nei referti genetici

Abbreviazione	Significato	Spiegazione semplice
del	Deletion	Missing DNA letters
dup	Duplication	Extra copy of DNA
ins	Insertion	Extra DNA letters inserted
fs	Frameshift	The DNA message is shifted, often causing major problems
missense	Missense variant	One DNA letter change causes a different protein building block
nonsense	Nonsense variant	A change creates an early "stop signal"
splice	Splice variant	Affects how the gene instructions are put together

Comprendere le alterazioni proteiche

Potresti anche vedere: p.Ile818fs

Il p. è l'acronimo di "proteina". Le proteine sono costituite da elementi più piccoli chiamati aminoacidi.

Isola = l'aminoacido isoleucina
818 = posizione nella proteina
fs = spostamento del quadro di lettura

«Alla posizione 818 della proteina, la mutazione del DNA ha causato uno spostamento del quadro di lettura.» Le mutazioni con spostamento del quadro di lettura spesso impediscono alla proteina di funzionare correttamente perché alterano il resto delle istruzioni genetiche.

Esempio di mutazione missenso

Variazione delle proteine: p.Arg72His

Arg = arginina (aminoacido originario)
72 = posizione nella proteina
Il suo = istidina (nuovo amminoacido)

Esempio di duplicazione

Variazione delle proteine: p.Glu402Argfs*15

Glu = acido glutammico (aminoacido originario)
402 = posizione della proteina
Arg = arginina (nuovo amminoacido)
fs = spostamento del quadro di lettura
*15 = un segnale di stop compare 15 aminoacidi più avanti

Che cos'è uno spostamento del quadro di lettura?

Il DNA viene solitamente letto in gruppi di tre lettere:

IL GATTO HA MANGIATO IL TOPO

Se si elimina una lettera:

L'ATA L'HA INCONTRATA A…

L'intero messaggio cambia. È un fenomeno simile a una mutazione con spostamento del quadro di lettura nel DNA. Le varianti con spostamento del quadro di lettura hanno spesso un effetto maggiore rispetto alle mutazioni che riguardano una sola lettera.

Cosa significa "de novo"?

Ciò significa che la mutazione genetica era di nuova insorgenza nel bambino e non è stata ereditata da nessuno dei due genitori. Di solito si verifica per caso durante la formazione dell'ovulo o dello spermatozoo. I genitori non ne sono responsabili.

Termini medici comuni presenti nei rapporti CASK

Termine	Significato
MRI	A brain scan using magnets
Microcephaly	Smaller than expected head size
Developmental delay	Slower progress in learning or development
Cerebellar hypoplasia	Part of the brain developed smaller than expected
Pontocerebellar hypoplasia (PCH)	Underdevelopment of the cerebellum and pons areas of the brain

Cose importanti da ricordare

I referti genetici sono spesso redatti in un linguaggio tecnico.
Due bambini con la stessa mutazione genetica possono comunque essere molto diversi tra loro.
Un rapporto non è sempre in grado di prevedere con esattezza come si svilupperà un bambino.
La ricerca sulle malattie genetiche rare prosegue senza sosta.

Un breve esempio

Delezione — Variante patogena nel gene CASK (c.2451del p.Ile818fs)

"È stata individuata una mutazione patogena nel gene CASK. Manca una base di DNA nella posizione 2451. Ciò altera la lettura della proteina a partire dalla posizione 818, il che potrebbe impedirne il corretto funzionamento o addirittura la sua stessa sintesi."

Missense — Likely pathogenic variant in CASK gene (c.214G>A p.Arg72His)

"Alla posizione 214 del gene, la lettera G del DNA è stata sostituita dalla A. Ciò ha determinato la sostituzione dell'arginina con l'istidina nell'amminoacido presente alla posizione 72. È probabile che questo cambiamento aminoacidico influisca sul funzionamento della proteina."

Duplicazione — Variante patogena nel gene CASK (c.1200_1203dup p.Glu402Argfs*15)

"Una duplicazione ha modificato il quadro di lettura della proteina. A partire dalla posizione 402, le istruzioni della proteina sono state alterate e poco dopo è comparso un segnale di terminazione precoce. Ciò rischia di impedire alla proteina di funzionare correttamente o addirittura di essere prodotta."

Considerazioni finali

È del tutto normale sentirsi sopraffatti quando si legge un referto genetico per la prima volta. Non è necessario capire subito il significato di ogni abbreviazione. I team di genetisti, i consulenti genetici e le associazioni di sostegno ai pazienti possono aiutarvi a capire cosa significano i risultati per vostro figlio e per la vostra famiglia.